Опубликовав в середине октября список из 56 централизованных религиозных организаций, намеченных для ликвидации, причиной чего отчасти стало непредоставление действующих счетов, Министерство иностранных дел РФ отказалось сообщить, на какой стадии находятся планы ликвидации и почему именно эти 56 организаций попали в список.

В списке оказались староверы, Армянская Апостольская Церковь, католики, протестанты, несториане, мусульмане и буддисты. Ни одна из пятнадцати находящихся в списке организаций, с представителями которых удалось поговорить корреспонденту "Форума 18", не получила предупреждения из МВД перед публикацией списка. Две из этих организаций, как обнаружил "Форум 18", уже ликвидированы.

В списке нет ни одной религиозной организации, относящейся к юрисдикции РПЦ МП, хотя 309 из 562 централизованных религиозных организаций РФ относятся именно к ней. Владимир Ряховский из Славянского правового центра сообщил "Форуму 18", что общинам РПЦ МП было заранее сказано, как исправить свои бумаги. Протоиерей Всеволод Чаплин из РПЦ МП подтвердил, что министерство сделало "определенные комментарии" по поводу счетов их общин, но не смог сказать, когда это было. Представитель МВД заявил общине адвентистов: "Целью списка стало призвать религиозные организации к дисциплине".

Ряховский утверждает, что МВД создало специальный список общин РПЦ МП, у которых были ошибки в финансовой документации, и разослало им письма с предупреждениями. Поэтому общин МП не было в списке для ликвидации. Ряховский не указал источник своей информации.

Ряховский также объясняет всю ситуацию, с одной стороны, утратой специалистов в МВД в результате отмены Федеральной регистрационной службы, а с другой, назначением в мае 2008 г. Александра Коновалова, являющегося большим приверженцем РПЦ МП, министром юстиции.

Согласно закону о религиях РФ от 1997 года, три местных религиозных организации, существующие, как минимум, 15 лет, могут зарегистрироваться как централизованная религиозная организация, такая, как епархия или объединение. Она может служить защитой для других религиозных организаций, желающих получить государственную регистрацию.